Non esistono interventi chirurgici privi di rischi, infatti esistono delle possibili complicanze precoci come: infezione di ferita, sanguinamenti endoluminali (dentro lo stomaco), sanguinamenti intraddominali (dentro la pancia del paziente), fistole gastriche (apertura della rima di sutura gastrica), deiscenze anastomotiche (apertura spontanea della cucitura tra due visceri tra di loro suturati)
E infine complicanze tardive come: reflussi gastroesofagei, ernie interne, occlusioni intestinali.